从群体式课程走向个体式课程，从分科式课程走向整合式课程，从闭合型课程走向开放型课程，是上海金瑞学校课程设置的特点。
金瑞学校非常注重课程创新，正如金瑞学校总校长所说：“未来社会需要个性化的创新人才，创新人才需要有自主意识，那么学校就应该有所改变，改变一切以成人意志为主导的学校课程，以刚性制度为特征的学生学程。”
在国家课程方面，金瑞学校采取分层分类走班教学，从学生的实际情况出发，因材施教，让每一个学生都能顺利完成义务教育。
学校课程是金瑞学校课程体系差异化的体现，金瑞学校的学校课程注重实证性教学，强调个性化学习，共开设行走德育、智慧学习、语言人文、科技创业、高雅气质的跨学科及超学科等课程。
学生课程则是根据学生的天赋和兴趣爱好所设置的特殊课程，并且学校鼓励、引导学生自创课程，这也表明金瑞学校尊重每一个学生的个性化发展要求，是金瑞学校个性化的创新模式的重要体现。
除此以外，金瑞学校还针对各年级、各阶段开设了创意想象、智慧思维等多门超学科的智慧课程。
说到这里，就不得不提金瑞学校特色的选修课了，每天下午三点半，多达40+的金瑞学校选修课就正式开始啦，类型多样、内容丰富的课程可以满足每一位学生独特的学习需求。
不管你喜欢文学、艺术，还是科学、体育，在金瑞学校，都能在这里找到适合自己的选修课。
在五十多门选修课中，大部分课程由本校老师任教，老师们会根据所教科目发散思维，将兴趣与知识进行有机地结合。同时，为了进一步拓宽选修课的宽度并加强其专业性，学校还引进了优质的校外资源，蜚声国际的国标舞专业团队，乐高、拓展教育课程，射箭、篮球、足球等各种专业的体育教练，确保让所有学生的潜能得到长足的发展。
